在土壤生态系统中，不同种类的微生物常混居在一起，形成土壤微生物群落。它们在生长繁殖过程中常要求相似的环境条件，并在生活过程中彼此具有一定的联系。微生物不仅与土壤自然环境发生相互作用，在微生物群落内部、微生物与其他生物环境之间也彼此联系、相互影响。